Glavne razlike između membrana za nanofiltraciju (NF) i membrana za reverznu osmozu (RO) u filteri za vodu su njihova točnost filtracije, vrste uklonjenih tvari i scenariji primjene. RO membrane imaju točnost filtracije, s veličinom pora od oko 0,0001 mikrona, i mogu ukloniti sve otopljene krutine, uključujući bakterije, viruse, teške metale, soli i sve organske tvari. Nasuprot tome, točnost filtracije NF membrana je između mikrofiltracije i reverzne osmoze, s veličinom pora od oko 0,001-0,01 mikrona, a one uglavnom uklanjaju dvovalentne i viševalentne ione (kao što su kalcij, magnezij, sulfat), neke organske tvari i veće molekularne zagađivače, dok dopuštaju prolaz nekim monovalentnim ionima (kao što su natrij i klorid).
Što se tiče vrsta uklonjenih tvari, RO membrane mogu ukloniti ione, otopljene krutine, teške metale (živu, arsen), nitrate, fluoride, bakterije, viruse i organske spojeve u vodi, a sve otopljene nečistoće bit će uklonjene. NF membrane uglavnom uklanjaju dvovalentne i viševalentne ione (kao što su ioni tvrdoće kao što su kalcij i magnezij), neke organske spojeve (kao što su neki pesticidi i gnojiva), boje i mirise, dok zadržavaju neke monovalentne ione (kao što su natrij i klor), tako da neki prirodni minerali u vodi mogu se zadržati.
RO membrane prikladne su za primjene koje zahtijevaju vodu visoke čistoće, kao što je pročišćavanje vode za piće, desalinizacija morske vode, industrijska priprema ultračiste vode i laboratorijska voda. NF membrane prikladne su za primjene koje zahtijevaju djelomično uklanjanje tvrdoće i nekih organskih tvari, kao što je pročišćavanje vode za piće u kućanstvu (zadržavanje nekih minerala), blaga obrada industrijskih otpadnih voda, obrada hrane i pića, itd.
